Вътрешната пудендална вена е разположена в глутеалната (седалищна) област.
Той се намира между сакроспинозния лигамент и сакротуберозния лигамент в седалището и отзад (зад) седалищния гръбначен стълб, което е област от кост, която стърчи от долната част на таза.
Вътрешната пудендална вена лежи до вътрешната пудендална артерия, която довежда кислородна кръв в същия регион. Пудендалният нерв също се намира до тези два кръвоносни съда и инервира една и съща област. Вътрешната пудендална вена, вътрешната пудендална артерия и пудендалният нерв са свързани заедно от дебел лист тъкан, наречен обтурационен интернус фасция. Тази групирана група се нарича пудендален канал.
Вътрешната пудендална вена дренира изтощена с кислород кръв от перинеума, който е зоната между външните полови органи и ануса, и външните гениталии. Изцедената област включва луковицата на пениса (при мъжете) или клитора (при жените), аналната област и урогениталната област.
Притоците на вътрешната пудендална вена включват вената на луковицата (при мъжете), задната лабиална вена (при жените), скроталната вена (при мъжете) и долната ректална вена. Вътрешната пудендална вена се оттича във вътрешната илиачна вена. Въпреки местоположението си, дълбоката гръбна вена, която дренира еректилните тела на пениса (при мъжете), не преминава във вътрешната пудендална вена.